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Sydney se lance sur les traces de Khashinau, l'ancien patron de sa mère au KGB, afin d'en apprendre plus sur celle-ci...

Après avoir escaladé le Mont Subasio, Sydney est innocenté. Jack lui dit qu'ils étudient toujours la prophétie mais qu'ils recherchent désormais sa mère. Il lui dit qu'une commission spéciale avait conclu qu'elle avait survécu à l'accident. Sloane faisait d'ailleurs parti de cette commission et il n'avait jamais rien dit. Sydney veut absolument retrouver sa mère et demande de l'aide à Sloane qui lui accorde un congé. Mais le lendemain, Sydney est envoyé en mission sur Khasinau. Sloane lui explique que celui-ci était le supérieur de Laura au KGB. Elle part alors à Vienne avec Dixon où elle doit retrouver un agent à l'ambassade russe qui doit leur donner un micro puce qui contient des informations sur l'organisation de Khasinau. C'est un bal masqué et Sydney et Dixon dansent lorsqu'un homme demande à danser avec Sydney. Il lui dit que l'agent en question est mort et qu'ils doivent vite prendre la puce. Une fois au sous-sol, Sydney découvre que cet homme est Noah Hicks un agent du SD-6 et un ancien petit ami. Ils récupèrent la puce et s'envolent pour Los Angeles. Sydney lui demande pourquoi est ce qu'il est parti sans lui dire au revoir il y a cinq ans. Il lui dit qu'il lui avait envoyé un e-mail sous forme de publicité pour qu'elle le suive. Hors Sydney a filtré son ordinateur pour qu'il rejette les pubs. Pendant ce temps, Francie et Will trouvent un billet pour l'Italie dans la poche du manteau de Sydney alors que celle-ci avait dit qu'elle partait à Seattle. Ils décident de lui demander des explications. Quand à Jack, il doit à présent passer chaque semaine voir la psy suite aux derniers évènements. Sydney et Noah sont envoyés en Russie pour récupérer le noyau d'un ordinateur contenant des informations sur Khasinau. Ils parviennent à le prendre et sont poursuivis. Ils trouvent refuge dans une maison du SD-6 en attendant qu'on vienne les chercher. Là, ils commencent à discuter de leur vie, de leur relation puis se tombent dans les bras.