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Scénario par Daniel Arkin et Réalisation par Ken Olin.


Sydney parvient à fuir les gardes du corps de Jacqnoud et s'introduit dans un tunnel. Ensuite elle prend contact avec Marcus pour lui expliquer qu'elle les a vu implanter l'explosif dans le corps de Patel, au niveau de la poitrine. Dixon au courant, elle pique une voiture d'ambulancier tandis que Dixon, lui, kidnappe Patel. Cependant Jacqnoud arrive à les rattraper très vite et une course-poursuite sur la route s'ensuit tandis que Marcus essaye d'enlever l'explosif du corps de Patel. Mais Jacqnoud se rapproche de plus en plus de la voiture de Sydney ayant pour but de faire la faire exploser à l'aide de la télécommande qu'il possède et qui est reliée à l'explosif implanté. Heureusement, Dixon réussit à enlever la bombe à la dernière minute et l'envoie sur la voiture de Jacqnoud qui explose.
De retour de mission, Sydney se voir reprocher par Vaughn le fait qu'elle ne sache pas le nom du ministre que le SD6 lui avait dit de protéger. Syd s'excuse en disant que le temps lui manquait. Elle reçoit alors les fichiers concernant son père par Vaughn. C'est par ce moyen que Sydney découvre qu'une enquête avait été ouverte il y a maintenant 20ans concernant le fait que Jack aurait donné des informations secrètes aux Russes.
A peine rentée Sydney est ré-envoyée en mission par Sloane qui lui demande de ramener les données sur un vaccin allemand. Il tient les informations d'un scientifique que Sydney doit identifier. En fait le scientifique veut aider la CIA "donc le SD6" dit Sloane.
Quand Syd dit à Vaughn qu'en fait les intentions du SD6 sont de le donner à des terroristes, protégeant ainsi ses armées avant qu'une offensive biologiste ait lieu. Vaughn dit donc à Sydney que Paul Kelvin, un agent de la CIA, prendra la place de Schiller en prenant son identité.
Arrivée en Allemagne Sydney réussit à prendre les données du vaccin. Cependant elle croit qu'une personne la suit. Elle prend contact avec Marcus qui l'accompagne et il lui répond en lui donnant un rendez-vous différent de celui prévu.
Sydney prend Shiller sous son aile et le donne à la CIA, puis elle retourne au SD6 où le faux Shiller (Paul Kelvin) se voit dans l'incapacité de répondre à une question: Où le vaccin est-il fabriqué? Sloane le fait mettre dans une cellule et dit qu'il croit qu'il n'est pas réellement Shiller.
Quand le SD6 essaye d'aller sur le site pour des informations sur le vaccin grâce à une carte, la CIA parvient à avoir accès au serveur du SD6... Sur le site la CIA a mis des informations sans réelles importances. Sloane qui doute de Shiller demande alors à Marcus pourquoi il a changé le lieu de rendez-vous avec Sidney lors de la mission. Il lui répond qu'elle croyait que quelqu'un la suivait.
Cependant Fran a organisé une soirée "halloween"et a convié le neveu de Charlie en espérant le voir mais il n'est pas là. Quant à Syd elle convie Marcus, sa femme et ses enfants et il lui dit ce que Sloane lui a demandé. Sydney le remercie de lui avoir confié.
Fran dit à Will d'arrêter les recherches sur le décès de Dany pour Sydney. Celui-ci est d'accord mais donne rendez-vous à Kate Jones quand elle l'appelle mais il s'interroge sur sa réelle identité car grâce à son numéro sécurité sociale il a découvert qu'elle est morte il y a soi-disant 20ans. Quand a lieu le rendez-vous et qu'il lui dit ça on voit la jeune femme qui lui avait dit qu'elle était la maîtresse de Dany, s'enfuir.
Pendant ce temps à la CIA, Shiller se fait interroger par Vaughn. Ce dernier lui révèle la réelle identité du SD6 et qui il sont mais le chimiste ne le crois pas et décide donc de ne pas lui dire où se trouve l'usine. Mais quand l'agent Sydney Bristow arrive et lui déclare elle-même que son petit ami est décédé à cause du SD6, il change d'avis et révèle le lieu de l'usine: Baddenweiller.
Sloane demande à Jack de faire parler Shiller car il a des doutes sur son identité. Jack frappe alors "Schiller" et lui dit le nom de l'endroit de l'usine. Shiller-Delvin donne donc le lieu au SD6.
Sloane envoie en mission Dixon et Sydney au lieu dit et les charge de faire exploser l'usine. Dixon met donc un explosif relié à une commande mais Sydney le débranche, prend des tubes à essais qu'elle remet aux agents de la CIA déguisés en chimistes et sort pour rejoindre Dixon. Mais quand celui-ci appuie sur le bouton déclencheur de l'explosif, aucune réaction. Sydney lui dit alors qu'ils doivent s'enfuir mais Marcus, lui apprend qu'il a posé un autre explosif. Il le fait se déclencher et Sydney voit avec horreur l'usine exploser et les agents de la CIA mourir.