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Déguisée en Française, Sydney récupère une micro puce d'un contact appelé Thomas Connelly dans un restaurant parisien. Avant que l'échange ne se fasse, un assassin tue Thomas. Vaughn, qui surveille la scène de loin, l'empêche de tuer Syd. Alors que tous deux le coincent dans un coin, il se coupe lui-même la gorge avec un couteau.

Au bureau d'APO, Sloane dit à Jack et Sydney que les informations téléchargés à partir de la micro puce révèlent qu'un procédé biométrique permettant de repérer une cible est mise au point dans un entrepôt sécurisé en Autriche. S'il est attaché à une arme, le procédé pourrait faciliter le repérage d'un individu uniquement grâce à un échantillon de son ADN ou d'un scan biométrique. C'est la nouvelle génération de snipers.

Sloane dit à Sydney que l'assassin travaillait pour Sasha Korjev, un dealer d'armes, impliqué dans le développement de cette nouvelle arme. La mission de Sydney est de retrouver le système biométrique à Salzburg, en Autriche. Sloane charge Dixon de localiser Korjev mais Jack se porte volontaire pour le faire lui-même.

Weiss fait comprendre à Vaughn qu'il a tort d'espérer que son père, Bill Vaughn, est toujours en vie. Vaughn jure que c'était bien son écriture dans son carnet de bord. Weiss tend à Vaughn un papier sur lequel est écrit le nom Frank Murdoch, un ancien membre des Forces Spéciales à San Diego dont le nom du magasin est mentionné dans le journal de Bill.

Jack avoue ensuite à Sloane que la CIA souhaite que Korjev soit assassiné et qu'il pourrait s'approcher davantage de lui que Dixon. Il ajoute qu'il aurait dû éliminer Korjev des années auparavant, quand il "en a eu l'occasion".

Dans une boîte autrichienne, Sydney se lie d'amitié avec Sam, un serveur américain, et utilise son pass pour accéder au sous-sol. Elle trouve un rapport révélant que le procédé biométrique a été changé de place et doit quitter le pays le lendemain matin. Le rapport affirme également que ce procédé a été fixé à une arme.

Un garde tire sur Sydney. Elle le met KO et entend sur son talkie-walkie que l'arme se situe dans l'entrepôt de Delongpre – et que les gardes en ont maintenant après Sam. Après que Marshall a confirmé que Sam est bien un civil, Sydney s'échappe avec lui. Elle doit le confier à son contact autrichien pour qu'il le place dans un programme de protection.

A San Diego, Vaughn rend visite à Frank qui lui montre une photo prise par Bill en 1982. Frank dit que Bill manquait à ce point de scrupules qu'il lui a tiré dans le dos, fumé une cigarette en regardant son cadavre avant de partir. Plus tard, Vaughn ment à Weiss en prétendant qu'il n'a pas retrouvé Frank.

Le contact de Sydney à Salzburg arrive avec un inconnu pour prendre Sam, et elle sent que quelque chose ne tourne pas rond. Se rendant compte de sa trahison, elle les met tous deux KO et explique, à contrecœur, sa mission à Sam. Elle lui demande de l'aider à atteindre l'entrepôt.

En Angola, Jack rencontre Korjev, qui parle de lui comme d'un mentor. Plus tard, Korjev parle de la trahison de Jack. Celui-ci répond que c'est lui qui l'a trahit, et l'étrangle avec un fil métallique.

Arrivée à l'entrepôt, Syd découvre que l'arme est fixée sur un mini-hélicopter. Elle dit à Sam de l'attendre dans la camionnette. Elle se débarrasse du garde et tente de récupérer l'hélicoptère – mais le système est activé et la prend pour cible. Tandis qu'il fait feu, elle court à travers les rayons du bâtiment.

Pendant que Sam attend, il est blessé par un homme de main de Korjev. Sydney met le tireur à terre, mais l'hélicoptère continue de la viser. Sydney utilise le tireur comme un bouclier humain. L'hélicoptère, qui se rapproche, fait une analyse du corps et, croyant que sa mission est terminée, retourne se poser sur sa base.

Sydney arrive au bureau d'APO à temps pour voir Jack prêt à partir. Alors que Jack mentionne qu'il projette d'aller dîner avant de rentrer chez lui, Sydney lui demande si elle peut se joindre à lui, et ils s'en vont ensemble.