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Sydney, à bord d’un train, en petite tenue, séduit un homme pour accéder au contenu de sa mallette. Il l’ouvre, révélant un tube qui contient un isotope instable. Elle l’assomme et le prend, puis court dans le couloir. Un homme armé la suit et s’apprête à la pousser hors du train.

Shanghai, 72 heures plus tôt… Sydney, en tenue d’écolière, s’échappe avec un contact dans la salle de bain d’une boîte de nuit. Sa mission a mal tourné, un de ses collègues s’est fait tuer, et pour s’échapper, elle habille son contact en gothique.

A Los Angeles, Syd est jugée pour avoir violé le protocole, par la directrice Chase et est transférée dans un autre service. Sydney démissionne ensuite de la CIA. A Washington, Vaughn et Weiss parlent de la déprime de Vaughn après qu’il a découvert la trahison de Lauren. Vaughn annonce qu’il démissionne.

Sydney descend par un escalier du métro, ouvre une porte secrète et entre dans un bureau. La directrice Chase est là pour l'accueillir. Elle explique que Langley a approuvé cette division d’opération secrète seulement quelques mois auparavant. Dixon, Jack, Vaughn sont tous là – une équipe choisie par Sloane. Chase dit à Sydney en privé qu’elle a besoin des contacts de Sloane – et que l’équipe est un rempart contre une possible trahison de Sloane.

Sloane explique que leur unité de couverture est comme le propre SD-6 de la CIA, appelée APO – Authorized Personnel Only. Leur première mission prend pour cible le scientifique russe Yuri Kamarov, qui veut vendre un isotope à un acheteur inconnu sur un train biélorusse. Vaughn jouera le rôle de l’acheteur pendant que Sydney s’emparera de l’isotope. Celle-ci affiche clairement son mépris à l’encontre de Sloane.

Dans le train, Sydney arrive en trombes dans la chambre de Kamarov en prétendant que c’est sa chambre. Vaughn se fait passer pour Kamarov et rencontre l’acheteur, qui travaille pour M. Vafik, pendant que Sydney occupe le véritable scientifique. L’acheteur reconnaît Vaughn et demande à un de ses hommes de s’occuper de lui pendant qu’il part. Vaughn prévient Sydney, qui dérobe l’isotope. Il assomme l’homme de main et court au secours de Sydney. Il jette l’assaillant hors du train. Ils font l’amour. Après quoi, il demande à Sydney ce qui c’est passé à Wittemberg. Sydney a un flash back – elle lit un document top secret lorsque Jack entre.

Sloane demande à Sydney de parler à Nadia au sujet de Vadik, qu’elle a un jour suivit. Il dit que Nadia a quitté les services secrets et est retournée en Argentine après avoir découvert un artefact de Rambaldi et l’a rendu au gouvernement américain. En Argentine, Nadia refuse de revenir mais Syd lui dit que le bras droit de Vadik est Tomazaki.

Chez elle, Syd parle à Vaughn de Wittemberg – elle a appris que son père avait tué sa mère, Irina Derevko.