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Sydney se fait renvoyer de la CIA à cause d'une prise d'initiative en mission. En fait, ce n'est qu'un revoi déguisé puisqu'elle intègre une branche secrète de la CIA, l'APO sous les odres de Cordélia Chase. Elle remarque alors qu'elle va devoir travailler avec son père, Dixon et Vaughn sous le commandement de... Sloane.
Lors d'une mission, elle apprend que son père a tué sa mère, Irina Derevko.

Sydney doit faire appel à Nadia, sa demi-soeur, repartie en Amérique Latine car elle détient des informations concernant une mission.
Sydney se fait enlever et Nadia la sauve mais Sydney apprend que son père a tué sa mère afin de la protéger car celle-ci a demander à cet homme de la tuer. Jack a alors tué Irina pour que Sydney soit saine et sauve...
Nadia, à qui elle cache la vérité, lui promet devant la tombe de leur mère qu'elle retrouvera l'assassin et qu'elle lui dera payer !
Nadia est intégrée au APO, et Marshall aussi car ils ont eu besoin de ses illumations.

Sydney doit s'infilter chez un homme, Martin Bishop, qui a tué sa propre femme afin de couvrir ses intérets. Mais il la repère car la CIA, dirigée par Langley, a envoyé son raid trop tôt.
Sydney est alors retenue prisonnière avec Weiss qui dirigeait le raid de la CIA "officielle".
Mais Nadia et Jack arrive. Sydney est sauvée mais Nadia tue de plusieurs balles Martin Bishop avec un certain acharnement. Syd comprend que son père lui a fait croire que Bishop était l'assassin de leur mère.

Pour les besoins d'une mission, Sydney se fait passer pour une infirmière d'une organisation pour la protection de la santé et Vaughn pour un prêtre.
Il doit sympathiser avec la soeur d'un dangereux terroriste qui expérimente un produit cristalisant les memembres sur des êtres humains.
Sydney découvre alors que Vaughn est rongé par la mort de Lauren et qu'il doit affronter ses démons intérieurs.
Nadia voit une photo d'Irina jeune avec un bébé dans les bras. Pensant qu ec'ets peut-être elle, Nadia se tourne vers Jack mais celui-ci ne veut pas lui donner de détails.

Sydney et Vaughn doivent infiltrer une organisation russe terroriste. Ils se font passer pour un des nombreux couples mariés terroristes pour intégrer ce village qui, de loin, paraît tout à fait normal.
Leur mision consiste à retrouver une arme qui pourrait ramener la société à l'âge de pierre.
Mariés pour cette mission, on leur fait remarquer qu'ils sont trop distants... Ils doivent donc faire face à une certaine pression sur leur relation.

Scénario par Roberto Orci et Alex Kurtzman et Réalisation par Perry Lang


Sydney est déormais très méfiante envers son père. Néanmoins elle réussi à faire abandonner les accusations qui l'accable pour le sauver. Irina est donc blanchie et elle retourne dans une cellule au FBI. Parallèlement, Sydney est Vaughn sont mis en quarataine après leur mission à Taipei car ils ont peut-être été infecté par un virus mortel.

Dixon est persuadé que Sloane joue un double jeu et qu'il trompe tout le monde en essayant de rétablir l'Alliance.
Il en parle à Sydney et avec son aide, cette dernière profite du dîner d'anniversaire de Nadia afin de s'introduire dans le bureau de Sloane.

Sydney doit se dégiuser en serveuse pour les besoins d'une mission puis elle doit aller sauver un innocent avec qui elle a l'impression deredevenir étudiante.
Vaughn, quant à lui, va voir son oncle hospitalisé qu'il n'a pas revu depuis la mort de son père... Une infirmière lui dit que son oncle devait remettre cette clef à Bill Vaughn. Michael découvre le journal intime de son père mais uand il veut plus d'informations, il découvre que l'infirmière a disparue et qu'en faite elle ne travaillait pas à l'hôpital...

Vaughn retrouve un journal intime qui a appartenu à son père, Bill Vaughn. Mais il y découvre des faits vécus par son père après 1979, c'est-à dire après sa mort ! Il identifie même son écriture. Il se lance alors dans des recherches et en parle à Sydney difficilement.
Nadia est préoccupée car l'APO doit saisir un homme avec qui elle a travaillé... son passé douteux insoupçonné remonte à la surface !

Sydney part en mission à la Havane mais son contact, qui trahit son patron, est découvert et la mission tourne mal. Sydney est enterrée vivante à côté dans un cercueil avec pour compagnon, son contact mort.
Au APO, l'objet dérobé lors d'un mission succès est analysé par Marshall mais il répand un virus... Le APO est mis en quarantaine alors que Dixon est touché. Ils ne peuvent donc pas venir au secours de Syd qui est désespérée. Mais Marshall qui arrive en retard est donc le seul à pouvoir l'aider. Il part à sa recherche et réussi à la sauver avec l'aide du APO.

Vaughn est complètement omnubilé par ses recherches sur son père qu'il croit vivant. Sydney, qui tente de l'aider par tous les moyens demande à son père d'utiliser son ordinateur avec son accès niveau 6. Mais Jack met tout de suite au courant Sloane et le APO essaie de contrôler Vaughn. Ce dernier reçoit un coup de fil anonyme. On lui dit alors qu'ils ont des informations concernant son père... Pour pouvoir partir faire ses recherches, Vaughn double le APO avec l'aide de Sydney et pour la première fois, il lui dit "Je t'aime"...

L' APO n'arrive pas à localiser Vaughn, toujours sur les traces de son père. Sydney continue de le protéger mais s'inquiète de son abscence. A Paris, Vaughn recontre un contact qui va le manipuler.
Dixon, en simple mission d'escorte se fait tirer dessus par... Vaughn. Ce dernier apprend que son contact travaille pour "M. Sloane".
Marshall, quant à lui, s'inquiète de la santé de Jack car il est le seul à savoir qu'en sauvant Sydney et Vaughn lors de la dernière mission, il s'est exposé à des radioactivités très dangereuses.
Sydney doit rencontrer sa tante Katya afin de lui soutirer des informations mais celle-ci lui joue des tours !

Vaughn confie à Jack que son contact travaillait pour Sloane. Mais le APO découvre qu'un homme se fait passer pour Sloane.
Il se comporte exactement comme le "vrai" Sloane et cherche à rassembler l'oeuvre de Rambaldi comme au temps du SD6...
Nadia a peur que l'obsession de son père pour le prophète ne revienne et le rende fou. Le côté obscur de Sloane ressurgit alors qu'il doit faire face à l'homme qui se fait passer pour lui.

Nadia reçoit un appel de Sophia qui l'informe de sa venue à Los Angeles. Mais dès son arrivée, elle se fait hospitalisée à la suite de diverses blessures. Tout l emonde s'inquiète et Nadia renoue donc avec sa "nourrice"... Tandis que Sloane fait analyser les empreintes de cette femme...
Parallèlement, Vaughn et Dixon sont en mission. Dixon va alors de voir faire faca à ses démons passés.
Jack et Sloane révèle des secrets à Nadia et Sydney sur une de leur tante, Elena Derevko...

En mission à Vienne, Sydney et Vaughn ont du mal à se débarasser d'un homme de main de Sophia.
Quant à Jack, sa maladie s'aggrave très rapidement et il a d'importantes hallucinations. Sydney et Sloane font appel à un médecin qui a disparu de la circulation. Afin de le guerir, celui-ci suggère que Sydney se déguise en Laura Bristow. Syd doit donc tenir son rôle face à son père, ce qui la boulverse car elle apprend beaucoup de choses...

Le faux Sloane et se hommes se regroupent dans un monastère hongrois et perturbe les abeilles afin qu'elles attaque tout le monde. Ils assassinent ainsi tous les moines. Il est arrêté et examiné. Marshall découvre alors beaucoup de choses étranges...
Sloane avoue le but réel de sa société OMNIFAM.
Mais il est plongé dans une sorte de coma dans lequel il revit dans son passé avec sa femme et sa fille décédée... Il ne veut plus se réveiller, préférant le passé au présent.

Chase débarque au domicile de Sydney et de Nadia car elle soupçonne cette dernière d'avoir trahi le APO à cause d' Elena...
Sydney part à la recherche d'Elena et doit faire équipe avec Sloane afin de la retrouver. Mais celui-ci la double et rejoint le camp d'Elena...
Nadia, Syd et Dixon partent à leur recherche. Dan sun entrepôt désaffecté, qui est le repère d' Elena et de Sloane, Dixon se fait tirer dessus par Elena.
A son réveil, il affirme avoir vu une prisonnière dans un état second...Irina Derevko, la mère de Sydney et Nadia...
Quant à Vaughn, il obtient l'approbation de Jack de demander à Syd de se marier avec lui !

Jack doit avouer à Nadia que c'est lui qui a tué Irina. Il va, avec Syd et Nadia, essayer de savoir où elle se trouve en marchandant des informations à Katya Derevko, enfermée dans les locaux de la CIA.
Tous trois arrivent à retrouver Irina tenue captive par des hommes de main d'Elena. Ils décident de partir à la recherche de Sloane et Elena mais l'avion est arrêté par la CIA car Irina Derevko doit être intérrogée.
Finallement, ils arrivent à convaincre Chase qu'elle est indispensable à l'arrestation d'Elena et Sloane. Il vont alors les retrouver à Sovogda où une catastrophe a été déclenchée grâce au système de circonférence de Rambaldi.
Quant à Vaughn, il demande à Sydney de l'épouser. celle ci accepte implicitement mais lui dit de lui reposer la question sur la plage à Santa Barbara...

à venir